Q. バーコードを作成する際、全体を縮小してもいいですか？

あまりお勧めできません。
全体を縮小すると、高さだけでなく一本一本のバーの幅も縮小されることになります。バー幅が細くなると、バーコードスキャナにとって読み取りづらくなったり、まったく読み取れなくなったりする場合があります。
また、縮小の過程で、バー幅の比率がずれてしまう場合があり、これに因ってはバーコードが規格外となり、読み取れなくなったり誤読の原因となります。
高さと同様、バー幅の最小値が規格で定められている場合もあります。

詳細は、GS1 JAPAN (財)流通システム開発センター のホームページでJANコードの作成手順 寸法、色などを参照ください。